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技术天地
离子通道的研究方法
   

1、infrared dichroism(红外二色性):研究膜蛋白中的α-螺旋和β-折迭的方向性。

2、Sited-directed spin labeling:揭示依赖于TONB转移蛋白的转到途径。

3、Solid-state NMR:测定分子的三维结构,特别是和用于膜蛋白的结构测定。

4、Antibody imprinting: 辅助研究光适应性视紫红素四级结构的map sites.

5、Cross-linking: 用于研究蛋白之间的相互作用和作用位点的确定。

6、质谱(mass spectrosopy):不需要对目标蛋白进行纯化,需要的量只要pmol就可以。

7、Chemical modification fingerprinting:用于研究膜蛋白的结构和功能之间的关系。

8、AFM:用于研究脂和多肽之间的相互作用,对于膜蛋白的表面拓扑学进行分析。

9、Slovent accessibility method: 研究离子通道KCSA活化门控构象的变化

10、SDS-PAGE和perflurooctonate PAGE用于研究跨末区域之间氢键的情况,因为有可能形成发卡结构从而在凝胶中表现为泳动较快。

11、计算机方法:利用计算机模拟推测离子通道蛋白的功能,在分子动力学水平上对离子通道蛋白进行研究,但是离子通道蛋白的三维结构必须要知道,而这正是目前很难解决的问题。

MscL蛋白的结构在1998年利用X射线得到了确定,其结果显示两个跨膜区域的位置和1994年利用计算机模拟推测的结果是一致的。这说明在将来生物信息学的发展将对离子通道蛋白的结构预测起到重要的作用。

 
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第三军医大学新桥医院心血管病内科
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